Неизвестный похищает ученицу и едва не насилует её, но Бугипоп вовремя появляется. На этот раз он оказывается вторым «Я» парня по имени Акизуки Такая. Он пробудился во время совершения преступлений, связанных с предыдущими владельцами мантии Бугипопа.
В отличие от «Boogiepop Doesn’t Laugh», «Boogiepop Dual» — абсолютно оригинальное произведение, не основанное на романе.

Бугипоп никогда не смеется — мистическая манга, рассказывающая о противостоянии и романтических чувствах Бугипопа, защитника Земли, и Мантикоры, людоеда, принявшего облик девушки. В манге подробно описаны главные персонажи всей серии и события, на которые лишь ссылается сериал. В манге молодой парень Такеда, встречающийся с Токой Миясита, познакомился и подружился с Бугипопом, вселившимся в неё. А другой парень, Саотоме Масами, из той же академии, заставший Мантикору, влюбился в неё.