Неизвестный похищает ученицу и едва не насилует её, но Бугипоп вовремя появляется. На этот раз он оказывается вторым «Я» парня по имени Акизуки Такая. Он пробудился во время совершения преступлений, связанных с предыдущими владельцами мантии Бугипопа.
В отличие от «Boogiepop Doesn’t Laugh», «Boogiepop Dual» — абсолютно оригинальное произведение, не основанное на романе.